滤泡囊肿是犹豫卵泡上皮变形、卵泡壁结缔组织增生变厚、卵细胞死亡、卵泡液末被吸收或者增多而形成的。
1、正常卵巢周期仅有一个卵泡发育成熟，其余生长卵泡均在成熟过程中相继萎缩而闭锁。可能由于垂体促性腺激素中促卵泡激素分泌过量活促卵泡激素与促黄体生成素失去平衡，导致成熟卵泡不排卵而持续增长或闭锁卵泡退化不全，粒层细胞仍分泌液体而形成囊肿。
2、由于各种情况（如慢性盆腔炎）所致的卵巢充血状态，卵巢下垂，造成卵巢血运障碍，使白膜增厚，以致成熟的卵泡不能破裂排卵，泡内分泌的液体潴留而形成囊肿。
3、卵泡膜层血管因某种原因突然破裂，血液难以进入卵泡形成卵泡血肿，血肿逐渐吸收，血细胞成分融合消失，液体增多潴留而形成囊肿。
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